Smittspåra viruset i stället för virusbäraren

Den hälsosamme ekonomisten, Thursday 14 May, 2020
Bild: 2017-09/dsc01062.jpg

En prekär fråga när det gäller smittspårning är om man kränker den personliga integriteten. Så länge man samlar uppgifter om enskilda individer är problemet uppenbart. Men intressant nog finns det en lösning på problemet. Det är att spåra viruset i stället för virusbärarna.

Eftersom virus har en unik genetisk sekvens kan man identifiera Coronavirus med hög precision. Vid ungefär var sjunde överföring förändras viruset i någon del - man kan säga att viruset byter generation. Det handlar i de flesta fall om en helt obetydlig förändring, men förändringen gör att man kan spåra virusets ursprung. Man vet vilket virus som gett upphov till just detta exemplar.

Det här är väldigt intressant information i smittspårningssammanhang, eftersom det gör det möjligt att koppla ihop olika virus. Med fullständiga data om alla virus skulle det vara möjligt att spåra de exakta smittvägarna utan att kränka den personliga integriteten. Det är ett alternativ till att använda appar, som utgår från virusbärarens identitet.

För att det ska vara någon mening med att spåra viruset måste man dock koppla dess identitet till någon uppgift som berättar var viruset smittade ner bäraren. Som jag noterat tidigare behöver man inte spara mer än bärarens postnummer, vilket inte avslöjar särskilt mycket om smittbärarens identitet. Det finns 10 miljoner personnummer, men bara 77000 postnummer. Ett postnummer kan avse någon av drygt 100 individer och det är därmed svårt att enbart med hjälp av virusets genetiska kod spåra individerna som smittats.

Vilken information går det då att utläsa av virusets genetiska fingeravtryck och postnumret? Ja, om viruset förändras vid vart sjunde värdbyte kommer det att finnas genetiskt identiska virus som kopplas till samma eller olika postnummer. Genom att analysera alla genetiskt identiska virus kan man även identifiera smittvägarna. Man ser att virus A har rört sig från postnummer X till postnummer Y.

Med ett tillräckligt stort antal prover går det att skapa en överföringsmatris - där länkarna mellan postnummer är mer eller mindre starka. Två postnummer kommer att få starka länkar om det är vanligt att ett virus med samma genetiska kod återfinns i båda postnummerområdena. Allt talar för att matrisen över tid är relativt stabil, men den kan förstås förändras beroende på aktuella händelser.

Som jag noterat i ett tidigare inlägg är det för ett klustrande virus mer intressant att studera risker för smitta än att i efterhand kartlägga det exakta smittoförloppet. Med ett virus som sprids så snabbt som Covid-19 kommer smittspårarna ändå i regel att ligga flera steg efter.

Men med överföringsmatrisen kan kluster snabbt identifieras och varningar utfärdas för de individer som är kopplade till respektive postnummer. Det är överföringsmatrisen som avgör om ett virus som drabbar någon som bor i postnummerområde X kommer att vara en fara för någon som bor i postnummerområde Y. Varningen är därmed inte personlig och behöver heller inte utfärdas förrän det finns en statistiskt betydande sannolikhet för att en individ i postnummerområde Y verkligen kommer att smittas.

Ett vanlig smittspårningsapp kommer ofta att ge falskt alarm. En postnummerbaserad app visar däremot bara sannolikheten för att man ska bli smittad. Åtgärderna för att undvika smitta är någon som individen bestämmer själv över. Kanske köper man ett självtest, kanske avstår man från sociala kontakter eller också väljer man någon helt annan strategi? Det viktiga är att individen känner till risknivån i det aktuella området och att risknivån omedelbart kan justeras när någon i närheten visar sig vara smittad.

Även myndigheterna kan dra nytta av informationen. Trots att ingen enskild individ pekas ut kan förekomsten av virus mätas och analyseras - och sedan utgöra underlag för eventuella åtgärder. En konsert med många smittade syns omedelbart på kartan och konsekvenserna för övriga delar av landet kan beräknas på någon sekund.

Egentligen skiljer sig inte postnummerstrategin så mycket från de strategier man använt i Sydkorea, Singapore och Hong Kong - där man smittspårat enskilda individer. Den stora skillnaden är att man aldrig behöver avslöja enskilda individers identitet - trots det uppnår man samma mål som i dessa länder. För mer detaljer om hur postnummerstrategin fungerar i övrigt, läs gärna detta inlägg.

Är höjt grundbelopp i arbetslöshetsförsäkringen bra eller dåligt?

Den hälsosamme ekonomisten
Bild: 2017-09/dsc01062.jpg

En av de satsningar som förlängs i och med höstbudgeten är ett höjt grundbelopp i arbetslöshetsförsäkringen. Frågan är - påverkar detta arbetsutbudet positivt eller negativt? Det beror givetvis på vad de arbetslösa skulle ha levt av annars. Om personerna klarar sig på grundersättningen och slipper söka socialbidrag kan det innebära att de själva och resten av deras familj slipper hundraprocentiga marginaleffekter. Då kan det höjda grundbeloppet ha en positiv effekt på arbetsutbudet. …

Läs mer!

Ett raffinerat krav ...

Den hälsosamme ekonomisten
Bild: 2017-09/dsc01062.jpg

Noterar att Miljöpartiet hotar att avgå om Preems  tänkta raffinaderi i Lysekil godkänns av regeringen. Det är en bra fråga för partiet att avgå på och vi är nog många som hoppas att regeringen splittras. Det skulle göra samarbetet mellan L, C och S betydligt lättare, och politiken mer förutsägbar. Miljöpartiet hamnar i så fall på samma plan som Centern och Liberalerna - rent förhandlingsmässigt. Det blir också intressant att se om Miljöpartiet - likt Vänsterpartiet - i så fall försöker …

Läs mer!

Musikproblemet i Arvika bör tas på allvar

Den hälsosamme ekonomisten

Inrikesminister Mikael Damberg besökte nyligen Arvika för att diskutera ordningsproblemen som blivit allt större. Det har föranlett vissa att tala i nedlåtande och ironiska drag om de stora samhällsproblemen i Arvika - för övrigt min uppväxtort. "Hög musik ... Bah, ni skulle bara veta hur mycket hög musik det spelas i Stockholm." Stockholm … Läs mer!

Asynkron Javascript

Den hälsosamme ekonomisten

Har börjat en kurs i asynkron Javascript . Nämnde jag att jag hatar Javascript? Fast vissa saker måste man ändå ta tag i - det är som att plocka upp efter hunden när den gjort sina behov. Hata är kanske fel ord egentligen. Kanske mer att jag inte är helt överens med syntaxen. Hur som helst, den här kursen hos The Web Ninja är alldeles … Läs mer!

Virus, demografi och normal dödlighet

Den hälsosamme ekonomisten

En diskussion på Facebook om överdödlighet och underdödlighet gjorde mig som statistiker intresserad av frågan om vad vi egentligen kan säga om hur många som normalt bör avlida ett visst år eller en viss månad. Och när man tänker efter är frågan alls inte så enkel som den kan verka. Jag har sett ett antal diagram där den genomsnittliga … Läs mer!

Vad kan världen lära av exemplet Sverige?

Den hälsosamme ekonomisten

Noterar att Sverige lyfts fram som exempel på ett land som stoppat Covid-19 med relativt milda åtgärder. Spridningen av viruset ebbade ut, trots att man inte låste in befolkningen eller vidtog någon drastisk lockdown. Men vad borde vi ha förväntat oss - givet det vi nu vet om viruset? Jag skulle påstå att vi givet vår befolkningstäthet … Läs mer!

Klan bara ett nytt ord

Den hälsosamme ekonomisten

Det talas mycket om klaner nuförtiden. Men är det något nytt? Maffian i USA - den kanske mest ikoniska brottsorganisationen - hade en etnisk bakgrund. Corleone -ehuru fiktivt - är inte ett renodlat amerikanskt namn ... För att förstå klanen bör man nog fundera över vilka funktioner den klassiska maffian tillhandahåller. För det första … Läs mer!

Varför fasa ut fossila bränslen?

Den hälsosamme ekonomisten

Det verkar som om regeringen - på Miljöpartiets initiativ - vill snabba på utfasningen av fossila bränslen. Men hur smart är egentligen det, med tanke på att etanol i framtiden kan komma att framställas miljövänligt? EU inledde nyligen en offensiv för att främja användning av vätgas - befintliga naturgasledningar ska kunna transportera vätgas. … Läs mer!

När kommer den första naturvetenskapliga religionen?

Den hälsosamme ekonomisten

Har lekt med tanken att starta en ny religion, men inte en traditionell sådan utan en religion som är baserad på naturvetenskap. Faktum är att det redan finns flera existerande hypoteser om hur universum är konstruerat - men vi lär inte i närtid få reda på vilken av dessa som är korrekt, om någon. Så varför inte starta en religion som baseras … Läs mer!

Om bloggen

Den hälsosamme ekonomisten är en blogg som handlar om sjukvårdens organisation, incitament och klassisk liberalism - allt skrivet ur ett ekonomistiskt perspektiv. Webbplatsen använder tredjepartskakor (cookies) från Disqus, Piwik, Facebook, Google och Twitter för att anpassa innehållet och annonserna till användarna, tillhandahålla funktioner för sociala medier och analysera vår trafik. Vi vidarebefordrar information om din användning av vår webbplats till de sociala medier och annons- och analysföretag som vi samarbetar med. Du kan läsa mer om webbplatsens kakpolicy här. Denna sida drivs med webbverktyget Bolt. Av Mattias Lundbäck.

VR och Vårdvalssidan

Den hälsosamme ekonomisten finns även tillgänglig i VR. Har man HTC Vive eller Occulus Rift når man hifi://ekonomism genom att först installera appen High Fidelity som ger tillgång till en stor mängd olika virtuella världar. Sedan skriver man bara "ekonomism" i Goto-fältet i HiFi. Fältet motsvarar adressraden i en vanlig webbläsare.

Besök gärna www.vårdval.se - det enklaste sättet att hitta och jämföra vårdgivare.

Läs bloggkollegor

Anybodys Place Carl-Johan Westholm Cornucopia Danne Nordling Eskil Ullberg Fnordspottning Fredrik Malm Fredrik Segerfeldt Gustav Nipe Henrik Alexandersson Janerik Larsson Jonas Grafström Lennart Grundel Maria Abrahamsson Markus Uvell Mina Moderata Karameller Mattias Svensson Niclas Berggren Opassande Per Gudmundson Sjätte Mannen Tanja Bergkvist The Market Monetarist


Creative Commons-licens
Den hälsosamme ekonomisten av Mattias Lundbäck är licensierad under en Creative Commons Erkännande 4.0 Internationell licens.
Based on a work at https://www.ekonomism.us.

Sociala medier

Den hälsosamme ekonomisten är en blogg för dig som är intresserad av ekonomi, politik och teknik. Följ mig på Twitter för regelbundna uppdateringar. Läs mer om Den hälsosamme ekonomisten och Mattias Lundbäck här.


Linkonomism
Googelkonomism
Feedkonomism